Grand Theft Auto 3D là một bản mod dành cho GTA III nhằm mục đích tái tạo lại cách trò chơi trông như thế nào trước khi phát hành. Sử dụng ảnh chụp màn hình ban đầu, Alpha Mines và lối chơi trước khi phát hành, nhóm hoặc modder đã dành hơn 4 năm để tạo ra phiên bản GTA III ban đầu này. Sau chu kỳ phát triển dài này, bản mod cuối cùng đã được phát hành vào đầu tháng Giêng. Bản mod hoạt động với phiên bản PC của GTA III. Phiên bản GTA III này ban đầu được lên kế hoạch phát hành trên PS2 và Dreamcast. Nhóm sửa đổi muốn bao gồm càng nhiều nội dung phát triển ban đầu càng tốt, thậm chí thêm vào HUD ban đầu. Cách bố trí của Liberty City cũng rất khác biệt. Nhiều tòa nhà bị mất tích, được thay thế bằng các cấu trúc hẹp hơn hoặc cỏ. Phong cách nghệ thuật tổng thể có nhiều màu sắc hơn và giống với các tựa game hậu duệ GTA cũ hơn.
Người hâm mộ cũng có thể nhận thấy rằng xe cảnh sát và các phương tiện cấp cứu khác trông giống với những chiếc xe ngoài đời thực của chúng ở New York. GTA III đã nhận được một số thay đổi về hình ảnh sau sự kiện bi thảm hoặc sự kiện 11/9. Một trong những thay đổi đó là những chiếc xe cảnh sát trở thành màu đen và trắng thay vì những chiếc xe tuần tra màu xanh và trắng được tìm thấy ở New York và được thấy trong ảnh chụp màn hình ban đầu hoặc GTA III. Claude, nhân vật chính thầm lặng hay GTA III, trông rất khác. Như người dùng 3li0507 của diễn đàn GTA đã chỉ ra, Rockstar đã trải qua rất nhiều lần tạo dáng khác nhau cho Claude, có thời điểm khiến anh trông thực sự nhợt nhạt. Đội ngũ hoặc người sửa đổi không chỉ thay đổi trực quan GTA III cho phần này, mà còn chỉnh sửa cách xử lý ô tô, thay đổi cảm giác của trò chơi và làm rối tung các bit khác hoặc GTA III. Kết quả cuối cùng là một trò chơi có cảm giác như bị rơi khỏi một vũ trụ thay thế.